Gotham pretende abordar de uma forma totalmente nova o universo do Homem-Morcego, mostrando o jovem Bruce Wayne e Gordon apenas como um novato na polícia, sem falar que veremos inúmero vilões icônicos tendo suas origens mostradas nas telinhas. Por conta disso, o primeiro caso que o detetive Gordon deve investigar é justamente o do assassinato dos pais de Bruce.